در 50 امین سالگرد گودزیلا، او به سفری دور دنیا می رود تا دشمنان قدیمی اش را جمع کند و به جنگ با دشمنی به نام "هیولای ناشناخته" بروند...
یک سال پس از نبرد میان گوزیلا و مکاگودزیلا، دو هیولا به همراهی "مونثرا" برای مبارزه با گودزیلا پا به میدان می گذارند...
پس از ظهور یک گودزیلای جدید، دولت ژاپن با استفاده از استخوان بندی گودزیلای اصلی یک گودزیلای رباتیک می سازد تا...